Биология почв

Обсуждение кафедр факультета почвоведения МГУ
Аватара пользователя
Глея
Старейшина
Сообщения: 1288
Зарегистрирован: Пн фев 25, 2013 6:28 pm

Re: Биология почв — кафедральный форум (2005-2007 гг.)

Сообщение Глея » Вт мар 05, 2019 11:28 am

gosav
В том, Гамбринус, весь и прикол...

Аватара пользователя
Глея
Старейшина
Сообщения: 1288
Зарегистрирован: Пн фев 25, 2013 6:28 pm

Re: Биология почв — кафедральный форум (2005-2007 гг.)

Сообщение Глея » Вт мар 05, 2019 11:29 am

gosav
Например, было выявлено 100 видов (на одной почве). Каждый вид относится к той или иной жизненной форме (система ЖФ жужелиц разработана Шаровой И.Х.). Подсчитываем кол-во жизненных форм в сборах... получаем например 8 форм. При этом 40 видов относятся к форме "А" (условно), 10 к форме "Б", 10 к форме "В", 8 к "Г", 5 к "Д" и т.д. до суммы равной 100.
...

Как я определяю сходство?
Мне кажется (человеку, естственно немного далекому от зооогии и тд) гораздо в этом случае эффективнее, вместо разбивания на группы и сравнивания возможных совподений, подсчитать индекс разнообразия системы, или попросту индекс Шенона (так, вы сможете перевести всю накопившуюся информацию в нормальное числительное значение, что уж говорить, если у вас тип данных располагает для этого на все 100%!, и при этом ничего не потерять)
Если точно не знаете что это такое - поищите в гугле - там все будет нормально и в кратце расписано что и как считать. Потому что для любого типа данных, имеющих структуру как ваша, индекс Шенона, классический способ используемый для такого рода оценок.

Аватара пользователя
Глея
Старейшина
Сообщения: 1288
Зарегистрирован: Пн фев 25, 2013 6:28 pm

Re: Биология почв — кафедральный форум (2005-2007 гг.)

Сообщение Глея » Вт мар 05, 2019 11:29 am

Guest
Мне кажется (человеку, естственно немного далекому от зооогии и тд) гораздо в этом случае эффективнее, вместо разбивания на группы и сравнивания возможных совподений, подсчитать индекс разнообразия системы, или попросту индекс Шенона (так, вы сможете перевести всю накопившуюся информацию в нормальное числительное значение, что уж говорить, если у вас тип данных располагает для этого на все 100%!, и при этом ничего не потерять)
Если точно не знаете что это такое - поищите в гугле - там все будет нормально и в кратце расписано что и как считать. Потому что для любого типа данных, имеющих структуру как ваша, индекс Шенона, классический способ используемый для такого рода оценок.
Здесь совсем другой смысл задачи. Индексы разнообразия, выравненности и даже сходства, здесь не помогут. Если иметь в виду мою, конкретно эту, работу.
(Кстати, любая упаковка данных, приводит к их частичной потере)
Попытаюсь провести аналогию, для объяснения сути идеи данного метода диагностики.
Здесь связь такая же, как и между первичной структурой белка и последовательностью нуклеотидов в ДНК.
Так как такая связь есть между этими классами молекул, то можно "диагностировать (определять)" белок исходя из последовательности нуклеотидов ДНК.
- Две разных последовательности ДНК -> два разных белка.
А если мы высчитаем индекс Шенона или Маргалеффа и т.д., имея в качестве исходных данных информацию о видах нуклеотидов и количествах (шт.) каждого нуклеотида, то вряд ли по этим значениям можно будет сказать, что за белок синтезируется по такой матрице.

P.S.
По поводу индексов. У нас, их широко используют (в том числе и я), но для этого использования не достаточно совпадения типа данных. Для этого должна быть ещё и необходимость. Кроме этого любой результат (в том числе и величины индексов) надо будет ещё и объяснить.

Аватара пользователя
Глея
Старейшина
Сообщения: 1288
Зарегистрирован: Пн фев 25, 2013 6:28 pm

Re: Биология почв — кафедральный форум (2005-2007 гг.)

Сообщение Глея » Вт мар 05, 2019 11:29 am

gosav

QUOTE
(Кстати, любая упаковка данных, приводит к их частичной потере)
К счастью не любая... Где наш ненавистный винзип?? :)

QUOTE
А если мы высчитаем индекс Шенона или Маргалеффа и т.д., имея в качестве исходных данных информацию о видах нуклеотидов и количествах (шт.) каждого нуклеотида, то вряд ли по этим значениям можно будет сказать, что за белок синтезируется по такой матрице.

Так понятное дело что нельзя, точно так же как нельзя ничего по этому индексу сказать о самой структуре микробного сообщества (приминительно к которому он часто и используется), но это не означает что он бесполезный и ни о чем не говорит!

QUOTE
У нас, их широко используют (в том числе и я), но для этого использования не достаточно совпадения типа данных. Для этого должна быть ещё и необходимость. Кроме этого любой результат (в том числе и величины индексов) надо будет ещё и объяснить.

Исходя из того что у вас тема связана с диагностикой и тому подобными вещами, можно предположить что это должно быть в конечном итоге более менее понятно для простого обывателя. Мне поэтому и кажется что ваш способ подсчета пусть если и с фундаментальной точки зрения правилен (я надеюсь!), то для прикладной возможности использования я не вижу будущего...
Было бы конечно услышать мнение и кого нибуть еще, потому что мои, я думаю, вы более менее поняли...

Аватара пользователя
Глея
Старейшина
Сообщения: 1288
Зарегистрирован: Пн фев 25, 2013 6:28 pm

Re: Биология почв — кафедральный форум (2005-2007 гг.)

Сообщение Глея » Вт мар 05, 2019 11:30 am

Adamov

QUOTE(gosav @ May 31 2006, 05:49 PM)
Мне поэтому и кажется что ваш способ подсчета пусть если и с фундаментальной точки зрения правилен (я надеюсь!), то для прикладной возможности использования я не вижу будущего...
Было бы конечно услышать мнение и кого нибуть еще, потому что мои, я думаю, вы более менее поняли...
*


Приклодная возможность использования есть, я построил определительную таблицу (пока не публиковал). По ней удобно определять.

Однако, благодаря этому диалогу, я лучше понял суть своей идеи :)

Аватара пользователя
Глея
Старейшина
Сообщения: 1288
Зарегистрирован: Пн фев 25, 2013 6:28 pm

Re: Биология почв — кафедральный форум (2005-2007 гг.)

Сообщение Глея » Вт мар 05, 2019 11:41 am

nekky
Зачет по микологии состоится в среду (27.12) в 11.00.
Обратите внимание на 13-ый пункт,его не было на лекциях. Информацию по этой теме можно найти в Мюллере,Лефлере "Микология".

Аватара пользователя
Глея
Старейшина
Сообщения: 1288
Зарегистрирован: Пн фев 25, 2013 6:28 pm

Re: Биология почв — кафедральный форум (2005-2007 гг.)

Сообщение Глея » Вт мар 05, 2019 11:42 am

Gambrinus
Народ, выложите пожалуйста расписание экзаменов. А то не знаю когда у нас что...
точно знаю что во вторник социология.

Аватара пользователя
Глея
Старейшина
Сообщения: 1288
Зарегистрирован: Пн фев 25, 2013 6:28 pm

Re: Биология почв — кафедральный форум (2005-2007 гг.)

Сообщение Глея » Вт мар 05, 2019 11:42 am

Gambrinus
Народ, кто нить выложите расписание со всеми спецкурсами...

Аватара пользователя
Глея
Старейшина
Сообщения: 1288
Зарегистрирован: Пн фев 25, 2013 6:28 pm

Re: Биология почв — кафедральный форум (2005-2007 гг.)

Сообщение Глея » Вт мар 05, 2019 11:54 am

nekky
Понедельник
день для научной работы

Вторник
10.55-биохим
12.45-мелиорация (лекция)
15.30-мат.стат(лекция)

Среда
10.55 мат.стат.
12.45 мелиорация чнс 4.10/ситстематика и развитие актиномицетов чнс 11.10

Четверг
10.55 биохимия
12.45 мат.стат.(лекция)
14.50 физ.раст.(лекция)

Пятница
10.55 мелиорация (лекция)
12.45 физ.раст (семинар)
14.30 микология

Суббота
9.00 Социология (семинар)
10.55 социология (лекция)
12.45 Философия (лекция) чнс 7.10
14.40 философия (в дни,когда нет лекции семинар переносится на 12.45)

Аватара пользователя
Глея
Старейшина
Сообщения: 1288
Зарегистрирован: Пн фев 25, 2013 6:28 pm

Re: Биология почв — кафедральный форум (2005-2007 гг.)

Сообщение Глея » Вт мар 05, 2019 11:55 am

APL
Значить, расписание на второй семестр:

ПН - День военной подготовки (пламенный превед Нестеру!)
12-45 Микробная трансформация азота в почвах. Степанов. 199м
15-35 Экология почвенных водорослей. Зенова. 199м.

ВТ
10-55 Почвенная микробиология. Звягинцев. 199м
12-45 Матстат. Мешалкина. М2
15-35 Семинар по экологии. Чернов. 5Д

СР - Чёрная среда, так сказать.
9-00 Почвенные дрожии. Чернов. 199м
10-55 Почвообразовательные процессы. Владыченский. М2.
12-45 Экология. Лекция. Чернов. 199
14-30 Почвенные дрожжи. Практикум. Чернов. 199м.

ЧТ
10-55 Экология. Семинар. Чернов. 288
12-45 Физиология почвенных микроорганизмов. Умаров. 199м

ПТ
10-55 Матстат. Стационар.
12-45 Физиология почвенных микроорганизмов. Умаров.
15-35 Почвообразовательные процессы. 199м.

СБ
10-55 Философия. Лекция. 5Д. чнс 10.02
12-45 Философия. 221. чнс 10.02

Встречаемся в среду 7 февраля в 199м в 9-00.

Ответить